為加快人工智能技術與豬育種深度融合，推動基因組育種智能化轉型，近日，基因中心在AI賦能豬育種領域取得係列重要研究進展。基因中心王子帥副研究員以第一作者在農業國際期刊Journal of Integrative Agriculture（中科院農林科學一區top，IF=5.7）發表題目為“Bole: a knowledge-enhanced multi-agent framework for intelligent genomic breeding”的研究成果，基因中心研究員魏文康和張曉愛等人參與相關工作。

　　基因組育種已邁入高度數據密集型時代，然而，將海量異質生物信息學工具整合為連貫、可複用的分析工作流，仍是製約該領域發展的核心瓶頸。軟件依賴的複雜性、數據格式的多樣性以及分析流程的專業門檻，使得基因組分析的可及性與可重複性大打折扣，尤其對非專業用戶而言更是如此。

　　針對上述挑戰，中國農業科學院深圳農業基因組研究所聯合我院基因中心和香港科技大學（廣州）等多個團隊，開發了一個以知識驅動的多智能體AI平台，命名為“伯樂”。該平台通過約束大語言模型的推理過程，實現基因組育種分析的自動化與標準化。伯樂將分析模塊形式化為腳本單元，每個單元均明確定義輸入輸出及軟件依賴規範，從而實現對生物信息學工作流的係統化組織。框架內置基於模式定義的驗證機製，對大語言模型生成的分析方案與可執行代碼進行約束，確保工作流生成的可靠性與一致性。伯樂覆蓋了基因組育種的核心分析任務，包括全基因組關聯分析、遺傳力估計、種質資源評估和基因組選擇等。同時，框架完整保留了分析產物層麵的數據溯源信息，從根本上保障了分析結果的可重複性。通過提升工作流自動化水平、降低使用門檻並確保分析可重複，伯樂為人工智能與基因組育種的深度融合提供了一種可推廣的範式。伯樂平台已開源發布，訪問地址為 https://bole.zishuailab.com/。

　　本研究得到國家重點研發計劃、豬禽種業全國重點實驗室開放課題基金、深圳市優秀人才培養基金和廣東省基金等項目支持。

　　原文鏈接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2095311926003011

　　伯樂育種智能體平台功能示意圖